CIENCIAS NATURALES

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18/12/2017

Logran secuenciar por primera vez el genoma del calabacín

Investigadores de la UPV, pertenecientes al Grupo de Bioinformática y Genómica y al grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana (COMAV), han logrado secuenciar por primera vez el genoma del calabacín.  



AUTOR: UPV

CALABACIN IREn el estudio han colaborado también dos grupos americanos (Virginia Polytechnic Institute and State University (USA) y Boyce Thompson Institute for Plant Research) y dos grupos españoles (el Departamento de Biología y Geología de la UAL y el centro de la Mojonera del IFAPA).

 

La secuenciación del genoma del calabacín es el fruto de más de 10 años de investigación del equipo del COMAV de la Universitat Politècnica de València (UPV). “Todo este trabajo lo comenzamos con estudios sobre el cultivo y la mejora del calabacín, seguidos de la secuenciación de los primeros transcriptomas –colecciones de genes que se expresan en el cultivo-, la construcción de los primeros mapas genéticos y la identificación de regiones que contienen genes que controlan características de interés”, destaca Belén Picó, responsable del Grupo de Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAV.

 

Las actividades del grupo en genómica de calabacín se iniciaron en el marco de dos proyectos de investigación financiados por el Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA) y han culminado ahora con la secuenciación del genoma de esta hortaliza que se ha publicado en la prestigiosa revista Plant Biotechnology Journal.

 

Desarrollo de nuevas variedades

 

El trabajo desarrollado por los investigadores españoles constituye una herramienta de enorme utilidad que acelerará el desarrollo de nuevas variedades de calabacín, con mejores propiedades y más resistentes a plagas y enfermedades, así como a condiciones climáticas adversas –como sequía o temperaturas extremas.

 

“Conocer el genoma ayudará a la mejora de esta hortaliza. Esta herramienta ya está facilitando la identificación de los genes directamente implicados, no sólo en resistencia a patógenos, sino en otros caracteres de interés, como el estrés, características organolépticas, etc. Además, permite comparar el genoma de esta especie con los genomas ya secuenciados de otras especies relacionadas como el melón, el pepino, la sandía y otras calabazas (de gran importancia como portainjertos), lo que facilitará el transvase de conocimiento entre estos cultivos de gran importancia económica”, destaca Joaquín Cañizares, responsable del Grupo de Bioinformática y Genómica del COMAV.

 

Lucha contra el principal enemigo del calabacín

 

De hecho, la secuenciación del genoma del calabacín ha permitido dar un paso “esencial” para luchar contra uno de los principales enemigos del cultivo de esta hortaliza en la actualidad: el virus de la hoja rizada del tomate de Nueva Delhi (ToLCNDV).

 

Este virus, transmitido por la mosca blanca del tabaco, se detectó por primera vez en España en 2012, en los cultivos de Murcia y Almería. Se ha difundido rápidamente en España y la cuenca mediterránea, causando un enorme impacto en el cultivo de calabacín, en el que provoca que las hojas jóvenes se ricen y acucharen, pudiendo llegar a detener el crecimiento de la planta y a causar deformación de los frutos. El grupo del COMAV de la UPV trabaja en la mejora del calabacín para la resistencia a este patógeno en el marco de un proyecto financiado también por el INIA.

 

“Disponer de una herramienta como es el genoma permite ir más rápido en la identificación de los genes responsables de la resistencia a esta virosis. Hemos localizado las regiones del genoma que están involucradas en la resistencia a este patógeno. Así, nuestro trabajo contribuirá a que en el mercado pueda haber, en breve, nuevas variedades resistentes a este virus”, explica Belén Picó.

 

Información disponible y variedades tradicionales

 

Desde el inicio del proyecto, la información generada ha estado disponible para la comunidad científica y para las empresas. De hecho, los datos de este genoma ya han sido utilizados por otros grupos de investigación para localizar resistencias a hongos, mejorar la calidad y cuajado del fruto, optimizar el desarrollo de la flor e incluso recuperar variedades tradicionales.

 

Actualmente, Belén Picó coordina un nuevo proyecto financiado en la convocatoria de la Generalitat Valenciana PROMETEO para grupos de investigación de Excelencia, cuyo objetivo es desarrollar nuevas variedades tradicionales de cucurbitáceas adecuadas para la producción ecológica. La disponibilidad del genoma facilitará el desarrollo de estas nuevas variedades. 


DESTACAMOS

Importancia del cultivo del calabacín

 

El calabacín se encuentra entre los 10 cultivos que lideran el mercado hortícola a nivel mundial; es especialmente importante en regiones templadas y subtropicales. Su producción se concentra principalmente en los países económicamente más desarrollados, lo que hace que su valor económico sea muy elevado. En la Unión Europea se dedican a su cultivo un total de 38.900 ha, siendo Italia el principal país productor seguido de España.

 

Aunque en España su producción se sitúa por detrás de otras hortalizas de fruto, como el tomate o el pimiento, su producción, superficie cultivada y valor económico no dejan de aumentar, siendo el principal exportador de la UE (60,16% del total), fundamentalmente a Francia, Alemania, Reino Unido y Holanda. La producción nacional de calabacín se distribuye principalmente en las comunidades autónomas de Andalucía (83%), Murcia (4%) y Canarias (4%); es Andalucía la que concentra en su territorio prácticamente todo el cultivo y dentro de ella, Almería -exportó el 82% de la producción nacional de calabacín, con un valor de 250 millones de euros en la campaña 2015-2016.



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